Das Programm bietet einen intelligenten lernfähigen Junk-Filter, der Ihre ankommenden Nachrichten analysiert und auf Wunsch automatisch aussortiert. Thunderbird bietet Sicherheitsfeatures wie S/MIME, Digitale Unterschrift, Nachrichten-Verschlüsselung (mit Hilfe der Erweiterung Enigmail), Unterstützung von Zertifikaten und mehr. HTML-Nachrichten können formatiert aber auch ohne HTML-Code angezeigt werden, sodass man das Ausführen von gefährlichem Code vermeiden kann.
Mehrere POP-/IMAP-Postfächer sowie Newsgruppen können getrennt verwaltet werden; dabei bietet Thunderbird Etiketten, beliebig viele Adressbücher, Empfangsbestätigungen, Nachrichten-Filter und -Suche. Adressen können aus den lokalen Adressbüchern und über LDAP automatisch vervollständigt werden. Mit Hilfe von Erweiterungen können Sie dem Programm Funktionen hinzufügen, um Ihre persönlichen Zwecke zu erfüllen. Die Oberfläche des Programms können Sie mit Themes verändern und die meistgenutzten Funktionen beliebig in einer Werkzeugleiste anordnen.
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